2026年10月15日木曜日

2’-水酸基の保護基はアセタールレブリン酸エステル

三月に大好きな浅草で気になっていた店に勇気を振り絞って入ってみたときのメモです。

鶏よし (visited Mar. 2026)
住所:東京都台東区浅草1-8-2

-お通し (330 JPY)-
-RATING- ★★★★☆
-REVIEW-
酢モツ。
酢がキューっと効いてていいですね。
お上品な冷製のモツの締まった身が良きです。

-般若湯(935 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
程よい爽やかな甘さ。 そして、練れた味わいが続く。 酸味、苦味、辛さがやんわり。 気に入ったです。 名前もいいよね。

-5本セット (1,706 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
ササミ、だんご、白レバー、ねぎま、手羽先の5本。
順番に焼き上げられて都度提供されます。
まずは、ササミ。 清楚な中にも香ばしいロースト•フレーバーが印象的。
程よいソフトな噛み心地は至福。載せてある山葵との相性もいいし、添えてある(多分)酢橘(?)の酸味も味が締まっていいですね。
二番手は、だんご(つくね)。 こちらも匂いがいいですね。
コアシェルライクにゴキュゴキュなのは軟骨でしょうか
軟らかエリアとゴキュゴキュのコントラストが楽しいです。
味付けは、塩味キューっと。
滴る上品な肉汁と塩味のコンボが最高です。

ネクスト。
タレ仕様のねぎまと白レバー。 ねぎまは、もも肉の焦げの匂いが最高に香ばしくって、もっちりした心地よいキック、淡白さを伴うジューシーな旨み、そして食感と味のシナジーが織りなす醍醐味が堪らないです。
白レバーも旨い。
外はパツッとして中はむにゅとしたクリーミーなレバーですよ。
あと、大きさによって異なる食感も楽しめて面白い。

最後は手羽先。
やっぱ焦げたロースト香が最高です。
熱量の保持感が高く、塩味が沁みます。







-一松 (660 JPY)-
-RATING- ★★★★☆
-REVIEW-
清涼感のある甘さ。
スキットとしててよし。







-半熟玉子の鶏雑炊 (1,045 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
鶏の円やかなファッティー•ノートがクルー!
自然派鶏白湯な丁寧な味わい。
具の鶏肉は炙ってあんじゃないでしょうか。ロースト・フレーバーがとっても香ばしいです。加えて旨み艶やか。
あと、スパイシーな香り付けは山椒と胡椒のミックスでしょうか(自信ないけど)
和風をちょっと外した感じがとっても合ってると思いました。


鶏よしさんは雷門通り沿いにあって、何回も目の前を通っていて、何年も前から気になってはいたんですが、やっと行けて超ウレピくて大満足でした。


閑話休題


こんな論文を読んでみました↓

Synthesis of long and functionally active RNAs facilitated by acetal levulinic ester chemistry
Nucleic Acids Research, 2026, 54, gkaf1525

表題通り、長鎖RNA(max 215-nt)をSPOS (Solid-Phase Oligonucleotide Synthesis)で化学合成するお話です。オープンアクセスです。

近年、化学修飾された長鎖RNAの需要が高まっているそうです。
例えば、sgRNAとかpegRNAとかでしょうか。それから、合成mRNAのポリA末端に2'-O-メチルアデノシンを導入することでタンパク質発現が著しく向上することが見出されたりしています。
で、化学修飾されたRNAはIVT (in vitro transcription)とかではなく化学合成、即ちSPOS (Solid-Phase Oligonucleotide Synthesis)で合成しなければいけないわけなんですが、SPOSでは鎖長が伸びるほど各サイクルの反応コンプが困難となり収率が激減します。
さらにRNAの場合は、2'-位の水酸基の保護基が伸長反応過程で安定であり、RNAの分解を引き起こすことなく容易に脱保護されなければならないという要件を満たす必要があるので、DNAよりも合成難易度が高いです。

RNA合成における2'-位の水酸基の保護基はTBDMSがゴールデンスタンダードで、著者らの感触では120 nts程度までのRNA合成には凄くいいそうですが、それ以上の長さになると2'-位の立体障害により合成が厳しくなり、達成可能な最大カップリング収率はca. 97-98%程度にドロップしてしまうといいます。
また、シリル基の除去にはフルオリドを使うわけですが、フッ化物の除去にひと手間掛かり、大量製造やハイスループット合成向きではないと著者らは続けます。

じゃあ、TBDMS基に代わるオルタナティブな保護基はどんなのがあるのかという話ですが、これまで次のような保護基が開発されています。

(1) 2'-TOM (2'- tris(isopropylsilyl)oxy)methyl)
オキシメチルスペーサーがホスホロアミダイトの活性中心から嵩高いシリル基を遠ざけることにより、カップリング収率は>98.5%。但し、TOMの除去はフッ化物と高温が必要。

(2) 2'-ACE (2'-bis(acetoxyethoxy)methyl)
基本>99%のカップリング収率。5'-Oの脱保護にHF処理が必要(特殊装置が必要)。

(3) 2'-CEM (2'-cyanoethoxymethyl)
110-170 merのRNAを高収率で合成可能もCEMの除去に追加のフッ化物処理は避けられない。

(4) 2'-TC (2'-O-thionocarbamate)
ribozyme (54-mer)、sgRNA (100-mer)の合成実績有り。エチレンジアミンで脱保護 (これはアドバンテージ)

(5) 2'-PivOM (2'-O-pivaloyloxymethyl)
カップリング収率>99%、脱保護はシアノエチル基除去のためのDBU処置(1 M in CH3CN)後に濃アンモニア水処理3時間。

(6) 2'-ALE (2'-O-acetal levulinic ester)
マイクロアレイ上、DCIを使ってカップリング収率は99% (rG, rC) - 99.9% (rU, rA)。
脱保護はEt2NH/ACN (1:9, v/v), 90 minでシアノエチル基を落とした後、0.5 M ヒドラジン水和物 in ピリジン/AcOH = 3:2, 2 hr, rt.(ステップワイズにハイスループット)。
高いカップイング効率とカラム上でのDMTr-ON精製に対応しているのが魅力。

ここで著者らが目を付けたのが2'-ALE (2'-O-ALEホスホロアミダイト)で、そのケミストリーを利用して長鎖RNAの合成を試みます。

具体的なプロシージャーですが、自動合成で伸長反応が終わったら、ジエチルアミン/アセトニトリル (1:9, v/v, rt., 20 min)処理してリン酸基の保護基であるシアノエチル基を外し、アセトニトリルで濯いだ後、乾燥エチレンジアミン/トルエン (1:1, v/v)で2時間処理することでCPGからの切り出しとグローバルデプロテクションします(ジエチルアミン処理を施さないとRNAの分解が物凄い)。
この段階でオリゴ核酸のインターヌケレオチド結合であるリン酸基は電荷を持っているので、非極性かつ非プロトン性のトルエン中でRNAはCPGに物理的に付着していると言います。
次いで、不純物をトルエンとアセトニトリルで洗い流し、減圧乾燥してホルムアルデヒド(のアセタール)を除去し、粗製のRNAを水で溶出させて取り出します。
因みに、エチレンジアミンによる脱保護はBz保護にも適用できるんですが、UnylinkerやiBu保護の定量的な切断・脱保護のためには加熱が必要になります(なので、UnylinkerとiBu保護は非推奨。1つめのヌクレオチドがプレロードされたCPGを用いる)。

因みに、TBDMSモノマーを用いた所謂常法は、濃アンモニア水/エタノール (3:1, v/v, rt., 48 hr)でCPGからの切り出しとリン酸基と塩基の保護基を脱保護した後、無水NMP/トリエチルアミン/Et3N•3HF (3:4:6, v/v,. 65˚C, 2.5 hr)で処理してシリル基を切断後、ブタノールから結晶化させて粗製のRNAを取得します。

TBDMSモノマーとALEモノマーとのザックリした合成条件の比較は次の表のような感じになります↓

ALE法はTBDMS法と比較してエコですね。
そして、EGFPレポーター遺伝子を標的にした99-ntのsgRNA (AK99)の合成を両者で比較しています。その結果、
   ALE法:2.2-3.1% yield
   TBDMS法:0.7-1.1% yield
とALE法がコンベンショナルなTBDMS法をアウトパフォームしました。
そして、化学合成したAK99の遺伝子編集活性も確認していて、HEK293T細胞でのEGFPノックアウト効率は70%超で、市販品を大幅にアウトパフォームしていたそいうです。

ネクスト。この結果に気をよくしたであろう著者らは、蛍光タグ付きsgRNA (109-170 nt, Mango IIおよびBroccoliアプタマーを組み込んだ蛍光sgRNA, 蛍光増強を確認, Cas9媒介切断活性を維持(エンドポイントでの切断率は80%超))、ミニマルmRNA (200-215 nt, 平均カップリング効率99.4%)の合成に成功しました。グレイト!

なかなかの成果ですね(蛍光タグ付きsgRNAとミニマルRNAの収率分かんないけど)。著者らは、ホスホロアミダイト法によるRNAの固相合成におけるルーチンなプラットフォームになると期待していると言います。

今後、ALEモノマーが上市するかどうかを注視していきたいと思う、二流大出のテクニシャン(研究補助員)のRNA合成メモでした。

2026年10月14日水曜日

白田温泉 2025:うなぎのお刺身を食べた話

梅のお宿 温泉民宿 宮田荘に宿泊して二日目の朝。
早速、万年温泉 (白田13号)をいただいてきました。
朝から源泉掛け流しとか、最高ですね!
そして、湯上がりにやってます↓

そろそろ朝食の時間です(朝食も部屋食)。

 -梅のお宿 温泉民宿 宮田荘の朝食-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
鯵の開きと蟹の味噌汁の朝飯とか、サイコーです。
宮田荘さんは純ジャパの気持ちを良く分かってますね。
こういうのがいいんですよ。こういうのが。

ところで今更ですが、みなさんは「白田温泉」ってご存知でした?
近隣には熱川、稲取、北川温泉というよりメジャーな温泉地があるというのに、なぜ白田温泉なのかと。

実は、ボクには源泉掛け流しの天然温泉以上にビッグな目的があったのです。
ズバリ、うなぎのお刺身です。
ボクはうなぎのお刺身が大好物なんですが、老舗・名店と言われる店であっても提供されることは稀です。
しかし、片瀬白田駅近にうなぎのお刺身を出してくれるお店があるのです。そして、そのお店こそが今回の旅の最大の目的。
では、張り切って行って参りましょう。うなぎ屋さんへ!

-うな瀬 (片瀬白田, visited Dec. 2025)-
住所:賀茂郡東伊豆町片瀬554-12

-菊正宗 (一合)(燗) (620 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
お通しは"ぬた"ですね。
極細千切り茗荷の香味が鮮烈で素晴らしです。
魚種は分かんないけど、ほんのり立ち昇るロースト・フレーバーと、しっとりした身と白身のフィッシー・テイストの滋味とのコンボが凄く美味しい。
味噌のソースはとても円やかで、自然な甘味が素材の味を引き立てます。


-うなぎ刺身(2,200 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
ふぐ刺しにも似た鬼キックで鬼淡白なその身からは、ほんのり滲み出る美味美味な脂。そして、フィニッシュには僅かな痺れ。
淡白だけど鬼ボディなので、ポン酢と紅葉おろしとに葱という布陣の薬味で大正解。
食すほどに口福が込み上げる味わいに感動しました。


-肝焼 (450 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
ドライめな仕上がりの身には、締まった旨味がふんだん。そして、苦味がクルーゥ。
透明感のあるメローな甘味のあるキリッとしたタレが美味です。
プルっしたところとか、コリュっとしたところなど、食感の起伏が楽しめるのも嬉しい。
夢中なって食べてたら、薬味の山椒掛ける前に食い尽くしてしまいました。


-地魚の握り寿司10貫 (2,760 JPY)-
-RATING- ★★★☆☆
-REVIEW-
新鮮で肉厚な地魚のお寿司一本勝負。
給仕の店員さんもちゃんと言えてなかったから、魚種はええでしょう。
烏賊は自然な感じの甘み濃厚で、ねっとり口腔内に纏わりつく感じがいいですね。
白身たちは鮮度の良さが感じられて肉厚でダイナミック。淡白な味わいの違いと食感の違いが楽しめます。
鮪は最初、「脂クドいじゃん」って思ったんですが、食べ進めていくうちに「あれ、クドくないじゃん」にイメージ・チェンジ。アッサリなトロットロというマジックな甘味。
あと、鯵系が二貫あったんですが、一方は超絶メローなのに対して、もう一方はサッパリした美味さ。どっちも美味しくて鯵食べ競べの儀は楽し旨し。
シャリは、ほんのり酸味にちょっと甘め。口に中での解れも悪くはない。
このお店はお寿司屋さんじゃないので、シャリが冷たかったり握りがちょいあまいのはご愛嬌。
生姜は薄くて辛くて良かったです。
握りとしてはイマイチだと思ったけど、ネタの海鮮は凄く美味しいですね。またいつか行くと思うけど、次行ったときはお造りをオーダーしようと思います。

参考までに、以前うな瀬に行ったときの簡単なメモです。

無事に目的を果たし、うなぎと地魚に満足したボクは帰りの電車の時間まで周囲を散策することにしました(特急停まらないし、電車の本数少ないんですよね)。

志理太乎宜神社に参拝しました。
鳥居の両翼の立つ銀杏が素晴らしいですね。

白田橋の下を流れる白田川。

線路脇の歩道(高架)が近過ぎてヤヴァイ!
手を伸ばせば電車に触れられそうな距離感に昂まります。
これ、都心だったらオーバーコンプライアンスで絶対許されんでしょ。

趣のある駅舎(片瀬白田駅)。

バイバイ、片瀬白田。バイバイ、うな瀬。

電車の時刻となり、ボクは片瀬白田を後にコンクリート・ジャングルに東京へと帰還するのでした。
帰りは、疲れたので熱海駅から新幹線に乗り込みました。
あっという間(45分くらい)に東京駅です。
なんか、東京駅の超絶雑踏が落ち着きます。そして、安心感からか腹がへりました。。。。。
片瀬白田の素朴さへのアンチテーゼなのか、無性にジャンクなものを食べたくなりました。

-電光石火 東京駅店 (visited Dec. 2025)-
住所:東京都千代田区丸の内1-9-1 東京駅一番街 B1F

-生ビール (750 JPY)-


-電光石火 (1,790 JPY)-
-RATING- ★★★★★
-REVIEW-
およそ食べ物の名前とは思えない料理名(?)は、肉・玉子ダブル・そば or うどん・イカ天・大葉・ネギ(九条ねぎ)かけからなる広島お好み焼き(そばをセレクト)。
まず、玉子が旨いですね。綺麗な旨味が濃いし食感もいい。
ソースはがマイルドで口に優しく馴染みます。
豚肉は普通に美味しくて、イカ天が濃厚な滋味深さを付与。
そばは軟らかくて味がついておらず、そばだけ食べても美味くないんですが、他の具材と一緒に頬張ると凄くいい。
九条ネギがたっぷり掛けてあるのも嬉しい。

インパクト大かつ可愛いらしいフェイスは目も楽しませてくれます。
ボクは二十代の頃から”もんじゃ”派なんですが、これは好きになっちゃいますね。

うん、東京で広島お好み焼き食べてジャンク・パワー充電。
明日からも千葉都民として東京で頑張っていける気がしてきました。

(了)